También se creará un atlas espacial MOSAIC de células cancerosas

Owkin, NanoString Technologies y las instituciones de investigación del cáncer University of Pittsburgh, Gustave Roussy, Lausanne University Hospital, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander- Universität Erlangen-Nürnberg y Charité – Universitätsmedizin Berlin lanzan MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas In Cancer) en el American Reunión anual de la Sociedad de Oncología Clínica.

MOSAIC es un proyecto de $50 millones para revolucionar la investigación del cáncer mediante el uso de ómicas espaciales, un conjunto de tecnologías que ofrecen información sobre la estructura de los tumores.

La ómica espacial permite a los investigadores examinar tumores con una resolución casi unicelular, al tiempo que revela la ubicación y la actividad molecular de las células tumorales e inmunitarias. Proporciona un mapa detallado de las interacciones moleculares, lo que permite a los científicos descifrar las relaciones clave entre un tumor y su entorno.

Al generar y analizar datos ómicos espaciales en combinación con datos de pacientes multimodales e inteligencia artificial, MOSAIC tiene como objetivo desbloquear la próxima ola de tratamientos para algunos de los cánceres más difíciles de tratar.

La primera iniciativa de este tipo que utiliza tecnología ómica espacial, Owkin dijo que MOSAIC tiene el potencial de abrir un nuevo campo en la investigación de tratamientos oncológicos. Owkin invertirá $50 millones para construir MOSAIC. Utilizará 7.000 muestras de tumores de pacientes, por lo que es más de 100 veces más grande que cualquier conjunto de datos de ómica espacial existente. Owkin y los socios de MOSAIC explotarán este recurso para los subtipos de enfermedades inmunooncológicas en busca de biomarcadores y terapias novedosas.

Thomas Clozel, cofundador y director ejecutivo de Owkin, dijo: "La convergencia de la ómica espacial, los datos de pacientes multimodales y la IA impulsarán la próxima revolución en la investigación oncológica, desbloqueando la próxima ola de tratamientos innovadores para los pacientes. MOSAIC nos ayudará , y nuestros socios logran avances sin precedentes en la lucha contra el cáncer".

Brad Gray, presidente y director ejecutivo de NanoString, dijo: "Este proyecto tiene potencial para transformar nuestra comprensión de la biología del cáncer y desencadenar el desarrollo de nuevos diagnósticos y terapias. Es una colaboración sin precedentes, que reúne las poderosas plataformas de biología espacial de NanoString, la más alta calidad muestras de cáncer clínicamente anotadas de los mejores centros de investigación del cáncer, y la extraordinaria tecnología y análisis de IA de Owkin".

Robert Ferris, vicerrector asociado de investigación del cáncer y profesor Hillman de Oncología en la Facultad de Medicina de la Universidad de Pittsburgh y director del Centro de Cáncer UPMC Hillman, dijo: "La Universidad de Pittsburgh está emocionada de ser parte de los consorcios MOSAIC, que aprovechar nuestra experiencia espacial-ómica del UPMC Hillman Cancer Center para comprender las células cancerosas en su entorno. Estamos entusiasmados de trabajar con otras universidades y socios de la industria para descubrir información procesable para detectar, tratar y prevenir el cáncer".

El perfil molecular resuelto espacialmente (también conocido como ómica espacial), reconocido como Método del año por Nature Methods, es un grupo avanzado de tecnologías para cuantificar y localizar la expresión molecular que ofrece a los científicos una vista de las estructuras tumorales con una resolución casi unicelular, revelando interacciones entre células tumorales y no tumorales.

Al medir la expresión de una molécula y mapearla hasta su ubicación dentro de la muestra del tumor, la ómica espacial permite a los investigadores "acercarse" a la heterogeneidad del tumor, la comunicación célula-célula y las interacciones tumor-sistema inmunitario. Este enfoque innovador está configurado para catalizar avances científicos sin precedentes y transformar nuestra comprensión fundamental de los mecanismos de la enfermedad.

Tras el análisis de los datos de los pacientes de los centros de investigación que utilizan la tecnología ómica espacial de NanoString, combinada con RNA-seq, proteómica, histología y otros datos médicos, Owkin desarrollará una plataforma de datos y utilizará el aprendizaje automático, incluidas las redes neuronales profundas, para descubrir la nueva biología del cáncer. y posibles terapias.

MOSAIC se centrará inicialmente en múltiples tipos de cáncer con necesidades médicas insatisfechas, incluido el cáncer de pulmón de células no pequeñas, el cáncer de mama triple negativo, el linfoma difuso de células B grandes, el cáncer de ovario, el glioblastoma, el mesotelioma y el cáncer de vejiga. Después de un período de investigación inicial, MOSAIC y sus métodos de análisis y generación de datos estandarizados estarán disponibles para la comunidad biomédica mundial, impulsando aún más los avances en la investigación oncológica.

La escala de MOSAIC supera significativamente los estudios ómicos espaciales existentes. Los esfuerzos anteriores son demasiado pequeños en dos órdenes de magnitud para impulsar avances. En la actualidad, la mayoría de los estudios que involucran estas modalidades de datos están limitados por tamaños de muestra, por lo general menos de 50. Por el contrario, MOSAIC analizará datos de 7000 pacientes, lo que permitirá a los científicos realizar investigaciones en cohortes de datos que son 100 veces más grandes de lo que es posible actualmente.