ASCO: IA

Imagen ómica espacial de tejido canceroso humano

Entre las grandes lecturas de ensayos clínicos en ASCO, un nuevo proyecto de investigación hizo su debut oficial con el ambicioso objetivo de mapear las interacciones de las células cancerosas con su entorno en "resolución casi unicelular".

El proyecto, denominado MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas in Cancer), reúne a una serie de organizaciones académicas de investigación del cáncer, así como a la empresa de inteligencia artificial Owkin, que se especializa en modelos de aprendizaje automático utilizados para encontrar nuevos biomarcadores y dianas terapéuticas a partir de muestras de pacientes y empresa de biología espacial NanoString.

MOSAIC está comenzando con $ 50 millones en fondos de Owkin, y utilizará una técnica conocida como "ómica espacial", que combina la secuenciación de genes con tecnologías de imágenes para analizar el ARN y las proteínas no solo por su presencia o cantidad, sino también donde están físicamente. ubicados en las células y el microambiente que habitan.

Según el consorcio, que reúne a la Universidad de Pittsburgh, Gustave Roussy, el Hospital Universitario de Lausana, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg y Charité-Universitätsmedizin Berlin, el proyecto de investigación es 100 veces más grande que cualquier ómica espacial existente. conjunto de datos Se espera que más organizaciones se unan al esfuerzo en los próximos meses.

Los datos se generarán de alrededor de 7000 pacientes con múltiples tipos de cáncer, según los socios, y podrían ayudar a los investigadores a comprender mejor el cáncer a nivel molecular, caracterizar diferentes formas de cáncer con mayor precisión e identificar nuevos objetivos que eventualmente podrían conducir a terapias nuevas y mejoradas. . Los proyectos actuales generalmente involucran a menos de 50 pacientes.

"Creo que la ómica espacial combinada con la IA es el catalizador para impulsar la próxima revolución en la investigación del cáncer", dijo el director ejecutivo de Owkin, Thomas Clozel, en una publicación de LinkedIn. "La combinación de genes con tejidos y de tumores con microambientes permite descubrimientos sobre los datos de los pacientes que los estudios de líneas celulares pasarían por alto".

Un objetivo clave del consorcio en los primeros días será desarrollar estándares para gobernar cómo se deben analizar y comparar los datos ómicos espaciales, con la esperanza de crear un libro de jugadas común para los grupos de investigación que operan en esta área. La esperanza es que, con el tiempo, los datos estandarizados y los métodos de análisis y generación de datos sean accesibles a la comunidad biomédica mundial, para acelerar la investigación en esta área.

MOSAIC se centrará inicialmente en los cánceres con necesidades médicas insatisfechas, incluido el cáncer de pulmón de células no pequeñas, el cáncer de mama triple negativo, el linfoma difuso de células B grandes, el cáncer de ovario, el glioblastoma, el mesotelioma y el cáncer de vejiga, dijeron los socios.